公司在支付工程款时应当索取。即单位和个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项，应当向收款方取得。开具工程款应当按一定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖专用章。
法律依据：《中华人民共和国管理办法》第二十二条：开具应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开行为：
（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的；
（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的；
（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的。
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