项目牵头人保证自己利益按照以下方式:
1.牵头方与联合体协议方签订联合体协议书，在协议书中明确项目牵头方和联合体成员方的职责以及权益。
2.项目牵头人与联合体协议方还要签订联合体内部实施协议，牵头人还可以通过内部实施协议保证自己利益。